晚上睡醒尿道口流脓水可能是淋病感染所致。

晚上睡醒后，身体处于静息状态，此时机体免疫力较低，不能有效地抵御淋球菌的侵袭，导致淋病症状加剧，表现为尿道口流脓水的情况。

此外，还应考虑非淋菌性尿道炎、膀胱炎等疾病的可能性。这些疾病也可能会引起尿道口分泌物增多的现象，但通常不伴随发热和腰痛的症状。

针对夜间尿道口流脓水的情况，建议患者及时就医进行相应的实验室检查，以确定是否存在细菌感染，并接受适当的抗生素治疗。同时还要注意个人卫生，保持外阴干燥清洁，避免过度清洗和使用刺激性强的洗液。