孕酮低不一定会导致肚脐眼疼。

孕酮水平低本身并不会直接导致肚脐眼疼，但如果伴随有子宫痉挛或收缩，此时会对肚脐周围组织产生一定的压力，从而引起疼痛。如果只是单纯孕酮低，并没有其他不适症状，则不会出现肚脐眼疼的情况。

若孕妇在孕期存在黄体功能不足、先兆流产等问题时，可能会表现为孕酮值偏低，进而影响到胚胎着床部位的稳定性和子宫内膜的健康状态，可能导致局部肌肉紧张或痉挛，从而引发肚脐眼疼痛的现象。

需要注意的是，孕酮水平下降可能会影响妊娠结局，因此建议定期监测孕酮水平，同时还要注意休息，避免剧烈运动，以免加重腹部不适。