扁桃体炎患者咳出咖啡色痰可能是咽喉部位存在慢性炎症所致，还可能伴有发热、食欲不振等症状。

扁桃体炎是发生于腭扁桃体的非特异性炎症，多由溶血性链球菌A组β-溶血性链球菌引起，可反复发作，病程长，容易迁延不愈。该疾病会导致扁桃体充血肿胀，进而诱发咽喉部毛细血管破裂出血，形成血凝块，随痰液排出则会表现为咖啡色痰。此外，患者还可伴随有发热、食欲下降、乏力等不适症状。

如果患者既往有吸烟史或患有肺结核，则可能会出现咳咖啡色痰的现象。这主要是由于烟草中的焦油或其他有害物质与口腔和呼吸道内的黏膜细胞发生反应，导致这些细胞损伤、坏死，并在咳嗽时被带出体外。此类患者需要戒烟以减轻症状，并接受适当的药物治疗如异烟肼片、利福平胶囊来控制结核病。

针对扁桃体炎引起的咖啡色痰，患者可在医生指导下使用阿莫西林克拉维酸钾分散片、头孢克肟颗粒等抗生素类药物进行抗感染治疗。对于因吸烟导致者，应减少吸烟量直至戒除，并可通过增加水分摄入和使用加湿器缓解症状。