药流不干净通常不会直接导致腰酸腹痛，但可能伴随其他症状如持续性出血。

药流不干净时，胎囊组织未能完全排出，子宫内膜未完全修复，此时身体处于一个非正常的状态，所以会出现腰酸腹痛的情况。

药流后若出现长时间或剧烈程度较高的腰酸腹痛，则可能是残留物引起的继发感染所致。因为残留物刺激会导致局部炎症反应，从而引起疼痛。

在药物流产后，如果发现有腰酸腹痛的症状，建议及时就医检查以确定是否存在残留物或其他并发症，并接受适当的治疗。日常生活中患者还要注意个人卫生，避免过度劳累，以免影响身体恢复。