衣原体和病毒感染的区别在于病原体类型、感染方式、传播途径、潜伏期以及治疗药物。

1.病原体类型

衣原体属于细胞内微生物，病毒则为非细胞型微生物。衣原体有完整的细胞壁结构，而病毒没有。

2.感染方式

衣原体主要通过性接触、母婴传播或呼吸道飞沫传播，病毒感染通常由空气中的微小颗粒、食物或水等媒介进行传播。

3.传播途径

衣原体可经由血液、性传播、垂直传播等方式扩散，病毒感染可通过空气、食物、水源等途径传播。

4.潜伏期

衣原体潜伏期较长，在2-5天之间，而病毒感染潜伏期较短，一般为数小时至数天不等。

5.治疗药物

衣原体感染可用四环素类抗生素如多西环素、米诺环素进行治疗，病毒感染则需针对特定病毒使用抗病毒药物，如利巴韦林、阿昔洛韦等。

在面对衣原体与病毒感染时，应避免盲目自我诊断及用药，以免延误病情。若出现相关症状，应及时就医并接受专业指导。