人流39天月经没来小腹痛腰酸可能是由内分泌失调引起的。

人流手术会对女性的身体产生一定的影响，可能会导致体内激素水平发生变化，进而引发内分泌失调的情况发生。内分泌失调会影响到正常的月经周期，从而出现月经推迟、小腹痛、腰酸等症状。

此外，患者可能处于排卵期或存在黄体功能不足等特殊情况时，也有可能会出现上述症状。此时需要进一步监测是否怀孕以及卵巢的功能状态。

针对人流后月经不调的情况，建议患者及时就医检查以确定具体原因，并接受适当的治疗。日常生活中注意休息，避免过度劳累，保持良好的心态也有助于身体恢复。