衣原体感染引起的低烧不退可能与免疫系统的过度激活有关。

衣原体感染后，机体免疫系统会针对病原体产生免疫应答，包括细胞因子、趋化因子等的释放，这些因素可以刺激体温调定点，导致持续性低烧。此外，衣原体本身也可能存在一定的致热原作用，进一步加剧了低烧的症状。

如果患者除了低烧外还伴有咳嗽、乏力等症状，则可能是由于衣原体感染引起呼吸道炎症所致。此时需要使用抗生素治疗，如阿奇霉素或多西环素。

在衣原体感染伴随低烧的情况下，患者应注意休息，避免剧烈运动，以免加重身体负担。同时，保持充足的水分摄入有助于降低发热带来的不适感。