怀孕两周小腹痛腰酸可以考虑孕酮支持、腹部超声检查、保胎灵、孕康口服液、针灸疗法等方法来处理。如果症状持续或加剧，应立即就医以排除其他潜在问题。

1.孕酮支持

通过补充外源性孕酮来维持妊娠，具体做法是根据医生指导选择合适剂量并在规定时间内服用。适用于因黄体功能不足导致的早孕期流产风险增加的情况。

2.腹部超声检查

利用高频声波成像技术评估子宫内胎儿状况及可能存在的异常情况。对于诊断早期宫内孕状态有重要意义，并可排除异位妊娠等其他潜在问题。

3.保胎灵

保胎灵是一种中成药，其成分如续断、菟丝子等具有滋阴补肾、固本培元的作用。患者按医嘱服用可以起到安胎的效果。此药物适合于因肾虚所致先兆流产、习惯性流产等引起的阴道出血、腰酸腹胀等情况。

4.孕康口服液

孕康口服液由太子参、砂仁等中药组成，能够调理脾胃气血，促进胚胎发育。该药物可用于改善孕妇因气血虚弱引起的小腹坠痛、腰酸腿软等症状。

5.针灸疗法

针灸通过刺激特定穴位调节体内激素水平，缓解疼痛症状。在有资质中医师指导下进行，可辅助缓解孕期轻微腹痛和腰酸。

孕期腹痛和腰酸可能是正常的生理现象，但如果症状持续或加剧，应立即就医以排除其他潜在的问题，如先兆流产或其他妇科疾病。