月经来后十二天腰酸小腹痛可能是黄体功能不足引起的。

黄体功能不足时，会导致孕激素分泌减少，影响子宫内膜的生长和修复，从而引发腰酸和小腹痛的症状。

此外，还应考虑是否存在卵巢囊肿、盆腔炎等疾病。这些疾病也可能导致上述症状，需进一步检查以确定具体原因。

针对月经期间出现的不适症状，建议女性注意保暖，避免剧烈运动，以免加重疼痛。同时，保持良好的生活习惯和个人卫生，有助于减轻症状。