男孩会阴型尿道下裂是因为尿道板两侧的组织分化障碍，导致尿道下裂，使得尿道开口位于阴囊与肛门之间。

会阴型尿道下裂是一种先天性畸形，通常由遗传因素引起，也可能是孕期激素水平异常造成的。这些因素会影响胚胎时期尿道下端的正常发育，导致其未能完全闭合，形成尿道下裂。

此外，如果患者存在肥胖、糖尿病等代谢性疾病，也可能增加患阴茎癌的风险。

针对会阴型尿道下裂，应避免局部摩擦或感染，以减少并发症风险。术后定期复查是必要的，以监测病情恢复情况。