睡醒觉后感觉蛀牙不舒服可能是由夜间口腔干燥引起的龋齿进展、细菌繁殖增加所致。

口腔干燥使得唾液对牙齿的保护作用减弱，易使食物残留在蛀洞内发酵产酸，加剧龋损；同时，干燥的环境有利于细菌繁殖，产生毒素刺激牙髓组织，引发疼痛。因此，睡醒觉后会感到蛀牙处不适。

如果蛀牙伴有感染或炎症，可能需要抗生素治疗，以减少感染风险。

日常生活中应定期清洁口腔，并注意饮食健康，避免过多摄入含糖量高的食物，以减少蛀牙的发生。