三岁宝宝肝功能异常可能是由遗传代谢性肝病、脂肪肝、肝炎病毒感染、胆道闭锁、药物性肝损伤等病因引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.遗传代谢性肝病

遗传代谢性肝病是由于基因突变导致肝脏无法正常代谢某些物质，从而引起肝功能异常。针对这类病因，可以考虑使用维生素E、水飞蓟宾等抗氧化剂进行治疗。

2.脂肪肝

脂肪肝是指肝脏内脂肪含量过高，超过肝细胞重量的5%，造成肝细胞受损和炎症反应，进而影响肝功能。改善饮食结构，减少高脂食物摄入，增加运动量，有助于减轻体重和脂肪含量，缓解症状。必要时可在医生指导下服用奥利司他、阿卡波糖等药物进行治疗。

3.肝炎病毒感染

肝炎病毒感染可导致肝细胞破坏和炎症反应，长期感染可能导致肝硬化或肝癌，进而出现肝功能异常的情况。对于由肝炎病毒感染引起的肝功能异常，患者可以在医生的指导下使用恩替卡韦片、富马酸丙酚替诺福韦片等抗病毒药物进行治疗。

4.胆道闭锁

胆道闭锁是一种先天性疾病，胆汁无法通过胆管进入小肠，导致胆汁淤积和肝功能损害。手术治疗是解决胆道闭锁的主要方法，如葛西手术或肝移植术。

5.药物性肝损伤

药物性肝损伤是由某些药物对肝脏产生毒性作用而引起的肝功能异常。轻至中度的药物性肝损伤通常停药后即可自愈，重度者则需要及时就医，在医生指导下使用拉米夫定、恩替卡韦等药物进行保肝治疗。

建议定期监测肝功能指标，以评估病情变化；同时，注意营养均衡，避免过度劳累，保持良好的生活习惯。