支原体、衣原体肺炎是两种不同的疾病，由于感染的病原体不同，所以临床症状也会有所不同，但都有上呼吸道感染的症状，如咽痛、干咳、头痛、肌肉酸痛等，还有可能引起皮肤症状、眼部症状、神经系统症状等。
1、上呼吸道感染：如果是肺炎支原体或鹦鹉热衣原体引起的上呼吸道感染，患者可能会出现发热、咽痛、干咳的症状，以及全身乏力、头痛、肌肉酸痛等症状;
2、皮肤症状：如果是沙眼衣原体引起的性传播疾病，可引起沙眼，患者可出现泌尿生殖系统的炎症，表现为尿道口红肿、脓性分泌物流出，女性患者还可出现阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎等，男性患者还可引起尿道炎、前列腺炎等，甚至导致不孕不育等;
3、眼部症状：如果是沙眼衣原体引起的性传播疾病，可引起沙眼，早期表现为结膜充血、流泪、异物感，后期可出现滤泡增生，甚至角膜血管翳形成;
4、神经系统症状：如果是鹦鹉热衣原体导致的鹦鹉热，患者可出现脑炎、脑膜炎、脊髓炎、咽炎、喉炎等，可累及肢体神经系统，出现头痛、嗜睡、颈项强直、抽搐等症状。
另外，对于衣原体感染引起的肺炎，患者可能还会出现淋巴结炎、咽炎、喉炎、扁桃体炎、鼻窦炎等肺部疾病。如果是生殖支原体、人型支原体及沙眼支原体导致的肺炎，患者可能还会出现泌尿生殖系统疾病，如尿道炎、盆腔炎、膀胱炎、输卵管炎等，或沙眼衣原体引起的性传播疾病，如尖锐湿疣等。
由于不同疾病的支原体、衣原体感染引起的临床症状不同，当怀疑存在支原体、衣原体肺炎时，应及时就医完善血常规、咽拭子、细菌学检查等，确诊后再进行治疗。
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