查体发现肝囊肿时，通常提示存在肝脏病变。正常人的肝脏中会有多个囊性结构，如胚胎时期残留的旧痕迹，即先天性肝囊肿；此外也可由后天因素导致，比如寄生虫感染、炎症刺激等。
一、先天性肝囊肿
1.胚胎时期残留：在胚胎发育过程中，肝内胆管和淋巴管退化不全，则可能在出生时通过B超检查出肝囊肿的情况，此时属于先天性的肝囊肿。
2.胆汁淤积：如果胎儿出生后的胆道发生梗阻，可使分泌的胆汁无法顺利排出，在肝内蓄积而形成囊肿。
3.血液循环障碍：由于循环障碍，使得门静脉血不能进入肝小叶内的窦状隙，从而引起囊肿的发生。
4.肝细胞或淋巴管生长：若肝外组织向肝内生长，或者淋巴管堵塞，也可能会出现肝囊肿。
二、后天性肝囊肿
1.寄生虫感染：常见于肝棘球蚴病，当人误食了含有囊尾蚴的猪肉后，会导致寄生虫侵入到肝脏内，并且在肝脏内进行不断的复制增殖，就会对正常的肝实质造成破坏，从而形成囊肿样改变。
2.炎症刺激：常见的有细菌感染所引起的肝脓肿，以及非特异性肉芽肿性肝病，包括肝包虫病等，均可导致肝囊肿的情况。
3.药物影响：长期服用双氯芬酸钠、甲氨蝶呤片等药物，也可能会影响肝功能，甚至诱发肝囊肿。
4.遗传因素：部分患者因家族遗传也会出现肝囊肿，其发病机制尚不清楚，考虑与基因突变有关。
5.其他原因：如肝吸虫病、硬化性胆管炎、原发性腺瘤性囊肿等因素，也可引发此情况。
对于较小的肝囊肿一般无明显症状，定期复查即可，而对于较大的肝囊肿则需要积极治疗，以免压迫周围组织而出现上腹部不适感、腹胀等症状。临床上常采用注射硬化剂、经皮穿刺引流术等方式来处理，必要时还需采取手术切除的方法来进行治疗。
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