侧边舌根有脓疱可能是舌根部淋巴滤泡增生、舌扁平苔藓、舌乳头炎、舌癌、口腔溃疡继发感染等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的治疗。
1.舌根部淋巴滤泡增生
舌根部淋巴滤泡是正常的免疫防御结构，在炎症刺激下易发生增生。患者可能会感到异物感、疼痛等不适。如果淋巴滤泡过度增生导致了明显的肿胀和疼痛，可以遵医嘱使用非甾体抗炎药如布洛芬进行止痛治疗。
2.舌扁平苔藓
舌扁平苔藓是一种慢性炎症性疾病，可能由遗传因素、精神压力大等因素诱发。典型表现为口腔黏膜出现白色条纹样病变，严重时可伴有局部糜烂、渗出等症状。患者可在医生指导下口服维生素E烟酸酯胶囊、多维元素片等药物补充维生素E和维生素B6，以改善病情。
3.舌乳头炎
舌乳头炎通常是由细菌或病毒感染引起的炎症反应，若不及时处理可能导致舌表面组织受损，引起疼痛和红肿。对于细菌感染引起的舌乳头炎，建议遵照医生的意见服用阿莫西林胶囊、氨苄西林丙磺舒分散片等抗生素类药物控制感染。
4.舌癌
长期吸烟、饮酒以及咀嚼槟榔等不良生活习惯，会导致口腔黏膜反复受到物理或化学性损伤，从而增加患癌症的风险。针对早期舌癌，手术切除肿瘤是主要的治疗方法，例如舌前三分之二部分切除术、半舌切除术等。
5.口腔溃疡继发感染
口腔溃疡继发感染是指由于免疫力低下或者病毒侵袭等原因导致口腔黏膜上形成的小型开放性伤口受到细菌入侵而发生的感染现象。此时由于炎症因子的刺激，会导致周围软组织出现充血水肿的情况，进而引发脓疱的症状。若是细菌感染所致，则需要配合医生通过涂抹碘甘油、盐酸金霉素软膏等方式来减轻炎症反应，促进愈合。
建议关注口腔卫生，定期清洁舌面，避免食用辛辣刺激性食物。必要时，可进行口腔内窥镜检查、活检等进一步评估病情。
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