导致眼球上有咖啡色斑的原因较多，可能是色素沉着、外伤等非疾病因素引起。也有可能是眼底视网膜出血、虹膜异色症、巩膜色素痣、脉络膜黑色素瘤等疾病因素所致。
一、非疾病因素
1.色素沉着：由于年龄增长或者长期使用糖皮质激素类药物等原因，可能会造成机体内的黑色素增多沉积在眼球上，出现上述情况，属于正常的生理现象，一般不需要特殊处理。
2.外伤：如果眼睛受到过外力撞击或者是化学物质刺激，会导致结膜受损，从而形成褐色血肿，也会表现为以上症状。此时需要及时到医院进行详细检查，根据诊断结果，在医生指导下使用消炎杀菌药膏涂抹，比如红霉素眼膏等，能够有效帮助病情恢复。
二、疾病因素
1.眼底视网膜出血：通常是由于高血压或糖尿病等基础性疾病所诱发，会导致玻璃体腔内出现积血，所以会发现眼球表面有棕色斑块，并且还会伴有视力模糊和眼前黑影等症状。此时可以在医生操作下通过激光治疗来改善。
2.虹膜异色症：发病原因与遗传有关，会出现虹膜发蓝以及虹膜缺失等情况发生，如果不及时地配合医生进行治疗，就容易诱发眼部病变，从而会引起眼球上的咖啡斑。此时可以遵医嘱服用氯雷他定片、盐酸西替利嗪胶囊等抗组胺类药物治疗。
3.巩膜色素痣：属于良性肿瘤，通常是因为基因突变所引发的眼部疾病，会对局部组织造成损伤，所以会有咖啡色斑点产生。如果没有明显不适症状，可以定期到医院复查。若影响美观时，则可以通过手术切除方法治疗。
4.脉络膜黑色素瘤：属于恶性肿瘤疾病，主要是因为基因突变或者是家族遗传等因素所致，会导致患者出现视力下降以及眼痛等症状，同时还会伴随眼球部位有咖啡色斑的情况。一旦确诊，需要尽快通过手术的方法进行治疗，才可以使身体恢复健康。
此外，还可能与交界性葡萄膜囊肿、血管瘤相关，建议去医院眼科就诊，明确诊断。
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