除了手术外，性功能障碍还可以通过中药调理、心理行为疗法、生活方式干预、荷尔蒙治疗、针灸治疗等方法来治疗。
1.中药调理
中医师会根据患者体质、舌象等辨证施治，开具个性化的中药方剂以调养气血、阴阳平衡。常用中药材包括人参、黄芪、巴戟天等。适用于因肾虚引起的性功能障碍，如阳痿、早泄等。
2.心理行为疗法
通过心理咨询、性教育和训练来改善患者的心理状态及性技巧，有助于恢复正常的性功能。常见的心理行为疗法包括性感集中训练和认知行为疗法。适合于由心理因素导致的性功能障碍，如焦虑、抑郁等。
3.生活方式干预
建议患者调整饮食习惯，增加运动量，并戒烟限酒，以促进身体健康和血液循环。具体实施可能涉及营养咨询、运动处方制定和行为干预。针对所有类型的性功能障碍都可采用，尤其对于非病理原因引起的案例效果更佳。
4.荷尔蒙治疗
通过补充或替代缺失的激素来调节内分泌水平，缓解由于低睾酮或其他激素失衡造成的性功能问题。例如，雄激素替代可用于降低女性性欲减退患者的症状。适应于存在明确激素异常的性功能障碍患者，需要在专业医师指导下使用。
5.针灸治疗
针灸通过刺激身体特定穴位来调节神经系统和内分泌系统功能，从而改善性功能障碍。常见穴位有关元、中极、三阴交等。适用于某些类型的勃起功能障碍以及射精控制问题，在有资质的中医师指导下进行。
在接受任何一种传统医学或现代医学治疗前，应确保无禁忌症且不存在药物相互作用风险。同时，保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食和适度锻炼，也有助于提高性健康水平。
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