临床上治疗扁平疣导致的瘢痕增生，主要是通过涂抹外用药物进行抗病毒、调节免疫以及促进表皮形成等。如果出现扁平疣导致的瘢痕增生，则需要及时到医院就诊，在医生指导下选择合适的药物进行涂抹。
一、调节免疫
1.维A酸类：如他扎罗汀凝胶或阿达帕林凝胶，可以抑制局部角质细胞过度增殖和诱导其分化，从而减少黑色素生成，达到改善色素沉着的效果。
2.糖皮质激素：可遵医嘱使用丁酸氢化可的松乳膏、糠酸莫米松乳膏等，具有一定的抗炎作用，能够减轻扁平疣导致的瘢痕增生症状。
3.水杨酸制剂：包括水杨酸软膏、苯酚贴膏等，有溶解角质的作用，有助于清除残留组织及坏死物质，但需注意避免长期大面积应用而引起刺激反应。
4.其他：患者还可遵医嘱选用咪喹莫特乳膏，该药对单纯疱疹病毒感染引起的扁平疣疗效较好，用药后一般无不良反应，偶见局部烧灼感、瘙痒、红斑与一过性低热等症状。
二、抗病毒
若扁平疣是由人乳头瘤病毒感染所造成，此时可在医生指导下使用重组人干扰素α2b凝胶，该药属于广谱抗病毒药物，对于多种病毒都有较强的抑制作用，且副作用较小。另外也可在医生指导下联合利巴韦林颗粒等药物共同治疗，以缩短病程。
三、促进表皮形成
当出现扁平疣导致的瘢痕增生时，可配合医生采用维胺酯维E乳膏等药物进行涂抹，此药为复方制剂，主要成分为维生素A、维生素E，其中维生素A有促进上皮生长、加速创面愈合的作用，可用于治疗痤疮、鱼鳞病、白癜风等疾病。
四、其它方法
部分人群存在瘢痕体质，此类人群建议采取激光的方式进行祛除，并且术后要做好护理工作，保持患处清洁干燥，以免引发感染的情况发生。
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