上海治疗韦格纳肉芽肿性巩膜炎可以考虑复旦大学附属眼耳鼻喉科医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海中医药大学附属曙光医院、上海市第六人民医院、上海长海医院等。由于该疾病较为复杂，建议在专业的眼科医生指导下进行治疗。
1.复旦大学附属眼耳鼻喉科医院
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院是国家卫生健康委指定的眼、耳鼻喉疑难重症诊疗中心，集医疗、教学、科研于一体。该院擅长眼、耳鼻喉疾病的诊治，其耳鼻咽喉头颈外科为国家重点学科，在韦格纳肉芽肿性巩膜炎方面具有丰富的临床经验。
2.上海交通大学医学院附属瑞金医院
上海交通大学医学院附属瑞金医院是一所三级甲等综合性医院，设有多个科室，包括神经内科、呼吸内科等。该医院拥有先进的设备和技术力量雄厚的专业团队，在神经系统疾病及肺部疾病的诊断和治疗方面具有较高的水平。
3.上海中医药大学附属曙光医院
上海中医药大学附属曙光医院是一家以中医为主、中西医结合的大型综合医院，设有多个临床科室。该医院在传统中医药疗法的基础上，针对韦格纳肉芽肿性巩膜炎可采用中药外敷、内服等方法进行治疗，具有一定的特色优势。
4.上海市第六人民医院
上海市第六人民医院是集医疗、教学、科研为一体的三级甲等医院，设有多个临床科室。该医院在眼科领域有着较高的学术地位和影响力，对于韦格纳肉芽肿性巩膜炎这类眼部疾病也有着较为丰富的研究经验和诊治能力。
5.上海长海医院
上海长海医院是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性三甲医院，设有多个临床科室。该医院在呼吸系统疾病以及免疫性疾病等方面具有较强的研究实力和诊治能力，能够为韦格纳肉芽肿性巩膜炎患者提供全面的医疗服务。
韦格纳肉芽肿性巩膜炎是一种慢性自身免疫性疾病，需定期监测病情活动性。建议患者避免接触已知过敏原，保持充足休息，遵循医嘱使用免疫调节药物如环磷酰胺或环孢素。
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