当发现直肠息肉是恶性时，需要根据直肠息肉的分期、患者的身体状况等进行综合判断。如果为早期阶段且患者身体情况良好，则可以行内镜下切除或经肛局部切除术；若为晚期则可能需遵医嘱使用化疗药物治疗。
一、手术方式
1.内镜下切除：对于直径较小的直肠息肉，可由专业医生在内镜下直接将息肉完整地从肠道黏膜上剥离下来并予以切除，从而达到根治的目的。
2.经肛局部切除术：适用于蒂粗大、基底宽、浸润较深的直肠息肉，在麻醉后用弯钳套住息肉蒂部，并轻轻向外牵拉，再应用高频电灼、微波烧灼、激光等方式对病灶部位进行处理，最后创面缝合即可。
3.腹腔镜下切除：部分直肠息肉位置较高，无法通过肛门切除，此时可在全麻下行腹腔镜下直肠息肉切除术，该方法创伤小、恢复快，但术后可能出现出血、感染等情况。
4.开腹手术：如肿瘤浸润范围广、癌肿较大者，可行腹部正中切口或右半结肠切口以清除原发灶及转移淋巴结，同时作造瘘术，待治愈后再行回肠末端与直肠吻合术，也可行姑息性切除术，即只做减瘤术而放弃根治术。
二、化学药物治疗
常用化疗药物有奥沙利铂、卡培他滨、伊立替康等，这些药物主要针对直肠息肉进展期和复发转移的患者，通过静脉输注给药的方式杀灭癌细胞，抑制其生长和扩散，从而延长生存时间。
三、放射治疗
放疗是指利用高能射线照射病变区域来杀死癌细胞或阻止其生长，常用于直肠息肉手术前后的辅助治疗以及不能耐受手术的晚期患者。常用的放疗设备包括直线加速器、质子刀等，放疗副作用较少，不良反应轻微，但可能会引起消化道不适、骨髓抑制等症状。
此外，中医认为直肠息肉属于“症瘕积聚”范畴，病因多与肝郁气滞、湿热瘀阻有关，因此还可配合中药治疗，应在医生辨证指导下用药，常见方剂有龙胆泻肝汤加减、少腹逐瘀汤加减等。日常生活中应保持规律作息习惯，避免熬夜，保证充足的睡眠，适当运动锻炼，有助于增强体质。
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