一般情况下，银耳用水泡开即可饮用，但如果使用真菌类银耳，则建议泡发后即时烹饪，未用的干燥的部分最好不超过2小时。银耳经过泡发后，就会有很多水分及粘性物质覆盖，如果不泡发，很难将其彻底软化，并且很容易变质、发霉，如果食用，可能会引起腹泻、呕吐等不良反应，因此建议泡发后即时烹饪最好。
干燥的部分一般呈浅黄色，其中还会含有大量的水分及银耳多糖，泡发后水分流失，但营养成分没有受到明显影响。另外，部分人群会对银耳过敏，应尽量避免食用，否则可能出现皮肤瘙痒、起红疹等症状。
银耳的营养价值较高，富含蛋白质、维生素、氨基酸、银耳多糖等对人体有益的物质，适量食用有助于补充营养。其中的膳食纤维有助于促进胃肠道蠕动，帮助消化，还可增强食欲、润肠通便。但银耳过量食用也可能对人体有害，因其滋补作用较强，尤其是用水泡发后，水分大量流失，如果储存不当，很容易发霉，如果食用发霉的银耳，可能会引起腹泻、呕吐等中毒症状，因此建议泡发后即时烹饪最好。
另外，部分观点认为，银耳只用水泡发即可食用，但其实并不存在这种说法。银耳用水泡发后，可导致银耳中的多糖等物质更易溶于水，而且银耳中的水分及银耳多糖还有助于保存，可一定程度上增加浸泡后的口感。但需注意，新鲜的银耳质地黏稠，如果用水泡发，很容易导致变质，建议尽早吃完。
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