月经刚完同房痛可能与生理因素有关系，如子宫腔创面还未恢复；但也可能与病理因素有关系，如炎症、子宫内膜异位症。
1、生理因素，女性在月经刚结束时，其子宫腔创面仍存在部分断裂的血管和腺管，微小血管还会有渗血现象，新的子宫内膜也才开始生长，表明还没有上皮覆盖。此时的创面，尽管已经不出血了，但仍未完全再生修复好。一旦在此时进行夫妻性生活，机械系的刺激动作就会使仍未完全再生修复好的创面受损，从而产生疼痛。
2、病理因素，阴道炎，如果患者有阴道炎，同房时龟头刺激就会导致炎症扩散加重，从而出现疼痛和不适的感觉。子宫内膜异位症。对于子宫内膜异位症的女性，就可能会出现同房疼痛。一般都是因为在同房深刺激的时候，而引起的疼痛表现，但是在同房结束后，这种疼痛往往能够自然缓解，一般不需要做特殊处理治疗。建议女性月经刚结束后最好不要同房，可以休息两天之后再同房。同时，要注意动作轻柔，最好不要过度用力。另外，同房之后也要及时进行清洁，避免感染。
3、女性在月经来潮后，激素水平处于基础状态，也就是激素达到生理过程的最低点，黏膜会受到雌激素的作用发生改变。但雌激素最低的时候，黏膜会相应变薄，同房的时候会有疼痛的感觉。这个时候女性进行同房一定要做好相应的措施，两方都要注意清洁、卫生，避免同房过度，以免造成黏膜破损。
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