病原微生物宏基因组检测有必要吗

病原微生物宏基因组检测有必要吗？我觉得是有必要的，宏基因测序可以覆盖细菌真菌病毒寄生虫。发热这么久常规抗生素无效，有糖尿病基础疾病，真菌，非结核分支杆菌，诺卡菌，放线菌等少见菌感染可能性大，要针对性的用药，疗程较长。病毒感染的话，常规抗生素也是无效的。虽然检测费用有点高，但对于感染性疾病诊断帮助很大，可以找到方向。相比不明确病原菌盲目使用抗生素治疗性价比高多了。

其实宏基因组在临床鉴定病原体上的应用已经非常广泛了，2020年12月复旦大学附属中山医院胡必杰教授发表了一篇高分综述，这篇文章详细介绍了测序技术在临床病原微生物检测中的应用情况。mNGS可广泛用于识别血流感染、中枢神经系统感染、呼吸道感染、骨和关节感染、尿路感染、消化系统感染等不同系统感染的病原体。

肺部感染一般推荐检测支气管肺泡灌洗液和痰液（这里要强调：样本与病灶的相关性越强，检测结果的阳性率就越高、越可靠）。研究表明，mNGS对苛养菌（如结核/非结核分枝杆菌、诺卡菌、放线菌、厌氧菌等）、病毒等检测的灵敏度优于或不劣于传统检测方法。针对非结核分枝杆菌的检测，肺泡灌洗液mNGS灵敏度要优于痰液样本。此外，mNGS在传统检测结果为阴性、经验性抗菌药物治疗效果不佳、复杂和非典型病原体感染的诊疗方面具有重大应用价值，在免疫功能低下患者、不明原因发热患者、不明原因肺炎患者的病原体鉴定方面优势明显。